教学优势
曙海教育的课程培养了大批受企业欢迎的工程师。大批企业和曙海
建立了良好的合作关系。曙海教育的课程在业内有着响亮的知名度。
本课程,秉承19年积累的教学品质,以项目实现为导向,老师将会与您分享设计的全流程以及工具的综合使用经验、技巧。
课程简介:
DNASTAR培训
DNASTAR是完整的序列分析软件,用于分子生物学研究、蛋白质分析、基因组学和转录组学研究。
内容及介绍如下:
1、Adding sequence files for alignment in MegAlign Pro
介绍在执行比对之前添加和组织序列数据的不同方法,了解如何将不同的核苷酸和蛋白质序列加载到DNASTAR的MegAlign Pro应用程序中。
2、Choosing the best assembly strategy for your genomic sequencing data webinar
深入探讨了基因组测序数据的不同组装策略。DNASTAR高级产品经理Matthew Keyser帮助您确定何时使用不同的基于参考的和从头开始的方法,以及如何执行各种抛光和校正技术来关闭基因组。组装后,了解如何关闭缺口,并准备您的基因组序列进行注释和下游分析。
3、Coloring a structure in Protean 3D according to features or properties
展示如何将表面应用于DNASTAR的Protean 3D软件中的分子结构,如何为选定的特征着色,以及如何根据选定的生物物理或免疫遗传特性为整个结构上色。
4、De novo assembly and analysis of Sanger_ABI data
了解如何快速轻松地组装Sanger/ABI测序数据并进行下游分析。本视频向您展示如何完成装配设置,可视化,装配编辑和修剪,并使用SeqMan Ultra BLAST搜索。
5、Exome Analysis Tutorial
了解如何在Lasergene Genomics中以无与伦比的轻松和速度将来自所有主要NGS平台的外显子组重测序数据与参考序列进行比对。全面的组装后分析选项使识别和比较遗传变异以及结构和非编码变异变得容易。先进的基因过滤提供了确定变异对每个基因造成的破坏程度的能力。在本教程中,我们将向您展示完成NGS外显子组分析所需的一切。
6、Fast ways to do multiple sequence alignment in MegAlign Pro
DNASTAR高级软件工程师Andy Thomas展示了使用MegAlign Pro应用程序运行多序列比对的两种非常快速的方法。MegAlign Pro是Lasergene分子生物学软件包的一部分。
7、Gap closure after de novo assembly using SeqMan Ultra
了解如何在完成重新组装后完成间隙闭合。本视频将根据您的具体数据介绍三种不同的方法。
8、Get to know SeqMan Ultra
了解我们用于Sanger序列组装和分析的最新应用程序SeqMan Ultra。凭借丰富的分析和可视化工具以及改进的算法,实现更快的组装和更高的容量,看看为什么SeqMan Ultra是序列组装和分析的新面孔。
9、How can DNASTAR's protein tools help you Webinar
展示如何使用综合蛋白质工具来研究和建模新型冠状病毒(2019-nCov)上的尖峰蛋白。作为演示的一部分,我们将向您展示如何将这些工具应用于您自己的数据,教您:
.分析蛋白质结构,进行结构比对,并为发表准备结构
.分析生物物理特性,预测蛋白质功能
.使用NovaFold蛋白质建模增强实验蛋白质结构数据或从序列数据预测结构
10、Lasergene Genomics overview
Lasergene Genomics提供转录组和基因组测序数据的组装、校准和分析所需的一切,所有这些都在一个集成的包中。我们支持传统和下一代测序分析,以适应各种工作流程,因此您可以使用一个软件包进行所有的NGS分析。
11、Learn SeqBuilder Pro’s annotation, primer, batch cloning and clone verification workflows
介绍了有关SeqBuilder Pro许多有用的工作流程的详细信息。
12、Predict the 3D Structure of a Protein Using NovaFold AI
DNASTAR的NovaFold AI应用程序使用AlphaFold 2算法,根据蛋白质序列预测蛋白质的3D结构。
13、Quick assembly setup in SeqMan Ultra
了解如何使用SeqMan Ultra和SeqMan NGen为Sanger/ABI数据快速设置和运行程序集。如果使用的是单样本数据,则可以快速添加序列并运行程序集,而无需指定程序集参数。
14、Quickly convert sequence files to a different file type
展示了如何使用SeqNinja应用程序在几秒钟内将一个或多个序列文件从一种文件类型转换为另一种。SeqNinja包含在所有三个Lasergene软件包中:分子生物学、蛋白质和基因组学。
15、Reference-guided Sanger sequence assembly in SeqMan Ultra 17.0 and 17.1
展示了如何在SeqMan Ultra 17.0和17.1中进行参考引导的Sanger序列组装和分析。SeqMan Ultra是DNASTAR Lasergene软件的一个组件。了解如何将多个样本的Sanger/ABI数据与参考序列或基因组进行比对。使用SeqMan Ultra快速轻松地比较样本,调查痕量和质量数据,并分析SNPs。
16、Reference-guided Sanger sequence assembly in SeqMan Ultra 17.2 and later
展示了如何在SeqMan Ultra 中进行参考引导的Sanger序列组装和分析。SeqMan Ultra是DNASTAR的Lasergene软件的一个组件。查看如何将Sanger/ABI数据与参考序列对齐。使用SeqMan Ultra快速轻松地比较样本,调查痕量和质量数据,并分析SNPs。
17、RNA-Seq Analysis using Lasergene Genomics Webinar
NA-Seq数据分析对许多研究人员来说是一个挑战,因为这项技术的应用非常广泛。本视频将演示如何使用Lasergene Genomics来获取RNA序列数据的全貌。
18、RNA-Seq Project Set Up in SeqMan NGen
了解如何在SeqMan NGen (Lasergene Genomics的一部分)中使用复制建立RNA-Seq项目。
19、Supported File Types in MegAlign Pro
了解DNASTAR的MegAlign Pro应用程序支持的不同文件类型,包括fasta文件和GenBank文件。
20、Variant Annotation Database Tutorial
逐步展示了Lasergene针对人类样本变体注释的工作流程。首先在SeqMan NGen中进行序列组装、变体检测和样本自动注释,然后在ArrayStar中进行变体过滤和分析。
21、What's New in SeqMan Ultra 17.2
展示了Lasergene的SeqMan Ultra 17.2中的许多新功能,包括Sanger序列组装,ABI序列修剪,导出对齐图像等等。
练习
答疑